接任国民党参谋长后，他未能改变战局的颓势
1948年5月，蒋介石在南京总统府内任命顾祝同为国民党军参谋总长，接替陈诚。虽然这一任命看似正常，但实际上反映出国民党面临的困境：能打仗的人未必听话，而听话的人缺乏战争能力。顾祝同是黄埔军校的早期军官，跟随蒋介石参与了北伐、抗战及国共内战，但相较于其他将领，他在军事指挥上的能力并不突出。蒋介石之所以选他，主要因为他绝对服从的态度。
当时的国民党军队内部流传着“打仗要靠本事，用人还得看是否听命”的说法，突显了蒋介石对能独立作战的将领的不信任。因此，顾祝同显得更加可靠。可战争的胜利不仅仅依靠忠诚，当他上任时，东北战局已经岌岌可危。辽沈战役展开后，国民党军在东北的局面迅速恶化，接连遭受败绩。作为参谋总长，尽管他并不直接指挥前线，但其职责在于全国的军事规划、兵力调配及作战协调。
在辽沈战役结束后，顾祝同并未被替换，反而升任陆军总司令。这种任用反映了蒋介石在乎政治忠诚胜于军事成功。1949年4月，人民解放军展开渡江战役，国民党军接连在华东、华中和华南地区退却，顾祝同虽在军事中枢，但局势已难以逆转。随着军队士气低落、后勤不足和指挥体系崩溃，任何将领都无法扭转败局。 新球体育
1949年下半年，国民党试图在西南地区延续抵抗，顾祝同被任命为西南军政长官。然而，西南各地缺乏统一指挥，导致形势迅速恶化，顾祝同在成都战役失利后，个人处于极端危机中，甚至在撤退时经历了重重困难。
他最终辗转逃往台湾，曾感慨“真是命大福大”，这句话反映了他在个人安全上的侥幸，更突显了他任内国民党军队的连续失败。顾祝同在台湾继续担任要职，直至1987年去世。他的任职虽未决定战争的全部结局，却始终与国民党军事的失败紧密相连。